超冷原子中的光子定量：Quest代替EMCCD的使用方法
超冷原子中的光子定量——Quest代替EMCCD的使用方法试
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在传统观念里，极弱光条件下使用的相机一般是EMCCD相机，而相对强一些的信号才会想到使用高分辨率、高速、高动态范围的sCMOS相机。所以，在超冷原子研究领域，尤其是针对极弱光的单原子成像中，传统上使用的是EMCCD相机。
随着光子定量CMOS芯片quantitative CMOS (qCMOS) 的横空出世，独家搭载该芯片的滨松Quest相机改写了这一传统，开创了光子定量成像的新纪元。Quest相机凭借极低的噪声，实现了光子定量（Photon Number Resolving）。光子定量相较于EMCCD的光子计数（Photon Counting），在识别单光子的同时，还做到了识别多光子的光子数目，即对光子进行定量。（详细原理参见http://share.hamamatsu.com.cn/specialDetail/1868.html）
超冷原子应用中，开启状态（On state）的原子/离子在激光激发下会发射荧光，而关闭状态（Off state）的原子则不会，这时，就需要qCMOS这样噪声极低的芯片来精确地分辨出这两种状态。成像时，使用相机的ROI功能（region of interest）选取荧光区域。
如下图所示，只有当相机噪声足够低的时候，才能使两种状态的原子/离子区分开。因为原子本身的激发荧光非常弱，所以相机噪声稍高，就会使On state和Off state原子/离子所在的像素，在读出光电子的过程中因为噪声的引入而无法区分，即没有确定的阈值可以将二者明确分离。
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对比滨松的EMCCD C9100-24B来看，EMCCD的像元尺寸是13μm x 13μm，而Quest相机的像元尺寸是4.6μm x 4.6μm.
所以如果使用旧EMCCD的光学系统，为了使画面等效，仅用binning来补偿像素大小差异，则会使Quest因像素尺寸小而无法在该系统中体现出光子计数的优势。
因为EMCCD及CCD类芯片的读出模式是所有像素通过同一套读出电路进行读出；而qCMOS及CMOS类芯片，为了实现CCD技术所无法触及的超低噪声，每一个像素都有单出的一个读出电路（FDA），而每一列像素都配有自己的低通滤波器（LPF）电路。
所以，在同一个光学系统中，通过Binning（像素合并）使Quest仅从尺寸上来等效EMCCD，则Quest的14 x 14个像素尺寸相当于EMCCD的5 x 5个像素尺寸，然而在做binning时Quest的噪声（以标准模式为例）被倍增了0.43 x 14=6.02，使光子定量功能失效。
为了使二者等效，建议通过变更光学系统的放大倍数来适配Quest的像素尺寸，这时就会得到真实的Quest低噪声所带来的光子计数性能。
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1.使用EMCCD的光学系统，仅更换相机
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可以看出由于过度的像素合并使噪声倍增，光子定量失效，Quest在EMCCD相机的光路中表现不如EMCCD。
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可以看出，光子定量的优势，使Quest在区分On state 和Off state原子/离子中体现出了非常明显的优势。
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由于Quest的小像元，如果用在原EMCCD光路中，会被错误地等效放大倍数而无法展现其真实性能。所以在应用中使用Quest相机替代EMCCD而充分利用其光子定量优势时，建议优化光学系统的放大倍数，以适配Quest相机的像素尺寸。
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